此时在福建发生了着名的“台江惨案”。
由于不断的爆发中日冲突，全国对日本人和日本产品都进行了强烈的抵制，所有国人商店都不买日货，谁家要是有日货，常会被激进的百姓抢出来砸烂烧毁。（民国百姓比当代天朝百姓激进多了，具体可见历史资料，并非西门杜撰）而在码头工作的中国工人拒绝卸载日货，日本人污蔑其为日本货物被劫，日本人受到生命威胁。于是为了给中国人一个教训，日本福建领事馆组成六十七人“敢死队”，由日本领事警察长江口善海率队，兵分两路进入福州寻衅滋事，中国巡警立即前来制止，也惨遭毒手。日本人的暴行遭到了福建百姓和警察的奋起反抗，民警合作将所有日本人擒获。而福建督军李厚基迫于日本人的压力，释放了行凶日人，激起了全国民众的愤怒，顿时，全国各地为支援福建百姓掀起了新一轮的集会游行，北京上海武汉成都西安沈阳天津总计四十多万百姓走上街头抗议日本帝国的无耻狂妄。北京北洋政府也向日本提出照会，日本政府不得已派出松冈洋右到福建调查。
实际上台江惨案不过是日本陆军内部对于中日新疆冲突的不满而做的一场试探罢了，却没有想到，会激起这么大风浪。王茂如立即作出反应，支持政府的决定，要求日本人立即道歉，并且撤换日本驻福建领事，并就此说明。
但是国民看到的却是。由尚武将军处理的中日冲突事件，逼迫日本人向中国人低头，杀了六十八个日本人谢罪，引发全国人民的骄傲和狂热。由皖系北洋政府处理的中日冲突，日本仅仅派出调查团调查，并未道歉，因此一直呼吁王茂如担任中央政府官员。甚至有心人扬言说：“中央软弱可欺，全因皖系乃日本人鹰犬，鹰犬怎会咬主人？”
如此挑拨的言论，自然王茂如不会去听。只是皖系官员听到之后绰绰不可终日，徐树铮甚至派遣心腹来到王茂如处拉拢团结。王茂如自然不会多想，只是对徐树铮提出批评，就是他私自枪杀陆建章一事坏了北洋规矩。
徐树铮听到之后怒不可赦，谓左右道：“王秀盛以为自己是谁？一地之督军而已，全都仰仗手下建功立业沙场作为，才有了他今日之成就，他真以为自己是北尚武？”不过知情人立即嘲笑起来，徐树铮嘲笑王茂如不会打仗全都仰仗手下。可徐树铮不单不会打仗，连手下都不能打仗。皖系这边与王茂如的东北系矛盾重重。那边又和直系闹起了矛盾，徐树铮连忙联合西北军张作霖，无暇顾及王茂如的口舌之争了。
1919年11月5日，在一场雪后，王茂如私自委任杨增新担任新疆省长后向北洋政府上报，由于其蒙疆巡阅使的身份，北洋政府回电允许其任命。同时由于王茂如率领军队在欧洲战场在俄国数次战斗，为国争光，由总理段祺瑞提议。总统徐世昌以及议会全体人员共同决定，委任王茂如为中华民国陆军次长，权力仅仅在陆军总长靳云鹏之下。
王茂如接到这份电报之后，疑惑地问：“段祺瑞这是要干什么？”