觉明驾驶着隐形飞船停留在耀斑级星舰的背部位置，然而要潜入这星舰也并非易事，因为，身处这星舰密集的星港重地，他们是绝不能暴露隐形飞船目标的，因为暴露就意味着被消灭。所以，这也就排除了使用飞船武器的可能性。
其实觉明也曾从崇明帝国的军事资料中了解过，这种纳野星人的生物系星舰，其实是一种硅基生命体，也就是他们之前见到的吞云鲸，星舰的外表层是一层厚厚的晶体状物质，十分坚硬。要想突破这层外壳，也只有动用机甲的炽红巨剑了才能做到了。
为了不闹出大的动静，觉明只得让莫夜先呆在隐形飞船里，而自己却唤出了机甲，随即来到舰体背部一个相对隐蔽位置上，并开启了机甲巨剑的聚能模式，当巨剑达到火红状态时，觉明将剑奋力刺入了舰体中，随着剑体游动，很快便在星舰背部开了一个直径约4米的圆洞。
可就在觉明准备与莫夜一同潜入舰体内时，一队翼龙飞船却出现在了他们的上空。觉明猜测这定是这生物系星舰的痛觉神经传递了被侵入的信息，所以他们才能做出如此及时的反应。但翼龙级飞船的到来，并没能阻止他们的潜入。
觉明与莫夜以极其敏捷的速度进入了星舰舰体内，此时，翼龙级飞船对于已经潜入星舰的觉明和莫夜也是无可耐何了，因为他们不可能对星舰开火，且以翼龙飞船的大小，也无法对他们进行追击。不过觉明和莫夜也绝不敢掉以轻心，因为两人虽然成功潜入，但同时也暴露了自己的目标。他们也并不知道这星舰的指挥官接下来将会给他们制造些什么麻烦。
当觉明和莫夜进入到这生物系星舰内时，几乎被眼前的景像惊得目瞪口呆，因为这与崇明帝国的星舰内部结构可谓大相径庭，就像到了另一个世界。星舰内密密麻麻地分布着许多白色的8面体的格室，格室与格室之间又由直径约3米的圆型通道连接，这种结构十分类似于蜂巢的蜂房，只是结构更复杂一些，似乎每一个格室都曾经孕育了一种生物的原始胚胎。
更让觉明感到奇怪的是，这耀斑级星舰的内部根本看不到任务功能结构，没有操纵台，没有武器操作系统，没有星图仪，没有生命探测仪，总之一切功能的结构都不存在。但实际上，这种生物系星舰与崇明帝国系列的星舰几乎具备了同样的功能。
也就是说，他具备这些功能，但看不出负责这些功能的设备，这就是这种生物系星舰的奇特之处了，觉明猜测，这种生物星舰的功能结构是集成在生物体体内的，他们的运行则是通过神经传输来传达指令。
此时，觉明与莫夜在格室与格室之间穿行着，他们试图尽快找到荒智雨的位置，但这些格室与圆通道组成的网络就像谜宫一般，就算你知道了大概位置，但沿着这些通道找过去，却是比登天还难。
此时，觉明手上的量子跟踪探仪上的红点闪烁着，这证明荒智雨目前还在这艘耀斑级星舰上，且仪器上代表荒智雨的红点正以缓慢的速度移动着，这也就证明荒智雨暂时还是自由的，活蹦乱跳的，这个情况，也让觉明稍稍舒了口气。